Ресурсы «Статьи»
_2K.webp)
Макарова М.Н., Крышень К.Л., Ковалева М.А., Макаров В.Г.
Выбор релевантных видов лабораторных животных в доклинических исследованиях эффективности и безопасности лекарственных средств является отдельной научной задачей. Ошибки выбора вида лабораторного животного могут привести к неверной интерпретации полученных результатов. Для обоснования выбора вида лабораторного животного авторы рекомендуют использовать 5 типов релевантности. Эпитопная релевантность основана на гомологии аминокислотной последовательности антигена и аффинности связывания in vitro. Оценка рецепторной релевантности учитывает эволюционное подобие рецепторов у разных видов животных как биомишеней лекарственных средств. Метаболическую релевантность необходимо рассматривать в случае биотрансформации лекарственных препаратов при проведении токсикологических исследований, а также ферментов и ферментных систем как мишеней действия исследуемых веществ при проведении фармакодинамических экспериментов. Морфофункциональная релевантность основана на физиологических особенностях строения и функции различных тканей, органов и систем в норме и при патологии. Техническая релевантность рассматривает возможные ограничения выполнения различных манипуляций с животными (пути и объемы введения с учетом лекарственной формы) при отборе биологических образцов (допустимое количество биоматериала), при инструментальных исследованиях и др. Для каждого вида релевантности приведены примеры. Предложенный подход, основанный на разных типах релевантности, позволит повысить трансляционность данных доклинических исследований, улучшит общие подходы к моделированию патологических состояний и снизит количество нерезультативных экспериментов.
1
Alexander Modestov, Anton Buzdin, Maria Suntsova
RNA editing is a crucial post-transcriptional modification that alters the transcriptome and proteome and affects many cellular processes, including splicing, microRNA specificity, stability of RNA molecules, and protein structure. Enzymes from the adenosine deaminase acting on RNA (ADAR) and apolipoprotein B mRNA editing catalytic polypeptide-like (APOBEC) protein families mediate RNA editing and can alter a variety of non-coding and coding RNAs, including all regions of mRNA molecules, leading to tumor development and progression. This review provides novel insights into the potential use of RNA editing parameters, such as editing levels, expression of ADAR and APOBEC genes, and specifically edited genes, as biomarkers for cancer progression, distinguishing it from previous studies that focused on isolated aspects of RNA editing mechanisms. The methodological section offers clues to accelerate high-throughput analysis of RNA or DNA sequencing data for the identification of RNA editing events.
Vladimir Veselovsky, Mikhail Romanov, Polina Zoruk, Andrey Larin, Vladislav Babenko, Maxim Morozov, Aleksandra Strokach, Natalia Zakharevich, Sadokatkhon Khamidova, Albina Danilova, Aleksey Vatlin, Vsevolod Pavshintsev, Feng Chenguang, Denis Tsybizov, Nikita Mitkin, Olesya Galanova, Alexander Zakharenko, Kirill Golokhvast and Ksenia Klimina
Comparative evaluation of sequencing platforms: Pacific Biosciences, Oxford Nanopore Technologies, and Illumina for 16S rRNA-based soil microbiome profiling