Обзор: "НАУКА и ОБЩЕСТВО". НАУКА. 6.
78 События первой половины октября 2023 из мира науки для Вас - в коротком обзоре "НАУКА и ОБЩЕСТВО. НАУКА.6."
Синтезированные бактерии обнаруживают опухолевую ДНК
Ранее бактерии были сконструированы таким образом, чтобы обнаруживать заболевания, реагируя на специфические метаболиты или патогены. Купер и др. сконструировали вид бактерий для обнаружения специфических мутаций в ДНК человека. Эти бактерии, Acinetobacter baylyi, обычно непатогенны и естественным образом способны замещать ДНК путем горизонтального переноса генов. Авторы воспользовались этим свойством, сконструировав эти бактерии таким образом, чтобы они становились устойчивыми к определенному лекарственному средству только тогда, когда они забирали ДНК, содержащую ассоциированную с раком мутацию в определенном онкогене, но не его аналог дикого типа. Бактерии обнаруживали свою мишень как в культуре, так и у мышей, несущих опухоли с соответствующей мутацией, после того, как бактерии были доставлены с помощью ректальной клизмы, что указывает на потенциальное клиническое применение.
Команда из Гонконга добилась прогресса в разработке ранней диагностики преэклампсии по внеклеточной ДНК
Новые данные продемонстрировали, что различия в размерах фрагментов ДНК, отличающие преэклампсию от здорового контроля, могут быть обнаружены с помощью метода ПЦР.
Исследователи во главе с пионером тестирования внеклеточного ДНК Деннисом Ло добились прогресса при разработке теста для более точного выявления преэклампсии у беременных, поделились новыми данными, демонстрирующими, что цифровую ПЦР можно использовать для обнаружения длинных фрагментов внеклеточной ДНК, которые могут отличить пациенток с развивающимся осложнением, от женщин с нормальным течением беременности.
Биологи научились редактировать гены некодирующих РНК
Ученые нашли способ редактирования генов некодирующих РНК с помощью системы CRISPR/Cas9. Некодирующие РНК регулируют работу генов, участвуют в передаче сигналов внутри и между соседними клетками, а также вовлечены в развитие наследственных, инфекционных (ВИЧ, гепатиты В, С), иммунологических и опухолевых заболеваний. Полученные данные помогут разобраться в механизмах этих болезней, а также предложить новые подходы к их лечению. Результаты исследования, поддержанного грантом Российского научного фонда (РНФ), опубликованы в журнале Non-coding RNA.
«Предложенная технология редактирования генов позволит определить функции некодирующих РНК и их молекулярных партнеров, в том числе в клетках человека. Эти молекулы могут послужить перспективными мишенями для разработки способов лечения или профилактики различных заболеваний, в том числе наследственных. Потенциальное лекарство может представлять собой некодирующие РНК или быть нацелено на них. Кроме того, полученные результаты важны для понимания регуляции живых систем и причин развития заболеваний: наследственных, инфекционных, возраст-ассоциированных и других», — рассказывает одна из основных исполнителей проекта, поддержанного грантом РНФ, Анастасия Ефименко, заведующая лабораторией репарации и регенерации тканей Института регенеративной медицины Медицинского научно-образовательного центра Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова.
https://indicator.ru/biology/biologi-nauchilis-redaktirovat-geny-nekodiruyushikh-rnk-25-09-2023.htm
Редактирование оснований с помощью CRISPR проходит клинические испытания
Американская биотехнологическая компания Beam Therapeutics проводит фазу 1/2 клинических испытаний высокоточного редактирования генома для терапии пациентов с острым Т-клеточным лимфобластным лейкозом и Т-клеточной лимфобластной лимфомой (T-ALL/T-LL). Терапия основана на редактировании оснований в CAR-T клетках при помощи CRISPR, и Beam Therapeutics объявила, что первый участник КИ получил терапию отредактированными CAR-T-клетками в августе этого года.
В качестве терапии рецидивирующей T-ALL/T-LL используются CAR-T-клетки, специфичные к CD7. В рамках текущего клинического испытания применяются аллогенные CAR-T, которым отредактировали основания в четырех генах: CD7, TRAC, PDCD1 и CD52. Модифицированные таким образом CAR-T не экспрессируют эти гены (терапевтический продукт получил название BEAM-201). Этот подход призван снизить вероятность фратрицида, реакции «трансплантат против хозяина» и истощения CAR-T-клеток. Кроме того, он может позволить самим CAR-T клеткам избежать действия анти-CD52 препаратов, которые используются при терапии для лимфодеплеции — удаления собственных Т-клеток пациента перед введением терапевтических CAR-T.
Выявлен новый биомаркер болезни Паркинсона
Шведские ученые показали, что анализ содержания декарбоксилазы ароматических аминокислот в спинномозговой жидкости способен выявлять пациентов с паркинсонизмом. Метод обладает чувствительностью и специфичностью более 80%, а также позволяет обнаруживать атипичные паркинсонизмы и имеет потенциал для ранней диагностики (до проявления клинических симптомов) и предсказания прогрессии заболевания.
Нейродегенеративные заболевания все чаще встречаются в современном мире. Одними из самых распространенных являются заболевания группы паркинсонизма — непосредственно болезнь Паркинсона, деменция с тельцами Леви (DLB), множественная системная атрофия и прочие. При этом диагностика болезней этой группы до сих пор проводится в основном по клиническим проявлениям. Опубликованное шведскими учеными исследование показало, что уровень декарбоксилазы ароматических аминокислот в спинномозговой жидкости и плазме крови может выявлять как типичный, так и атипический паркинсонизм еще до проявления симптомов.
https://pcr.news/novosti/vyyavlen-novyy-biomarker-bolezni-parkinsona/
Генетически модифицированные бактерии расщепляют пластик в соленой воде
Ученые из США генетически модифицировали морской микроорганизм, способный расщеплять в соленой воде пластик, в том числе полиэтилентерефталат (ПЭТ), который встречается повсюду: начиная от бутылок для воды и заканчивая одеждой, сообщает EurekAlert!. Открытие, описанное в журнале AIChE Journal, поможет решить проблему пластикового загрязнения морской среды.
Чтобы получить микроорганизм, разрушающий пластик, исследователи объединили два вида бактерий. Первая бактерия, Vibrio natriegens, процветает в соленой воде и очень быстро размножается. Вторая же бактерия, Ideonella sakaiensis, примечательна тем, что вырабатывает ферменты, которые позволяют ей расщеплять ПЭТ и поедать его.
Ученые взяли ДНК I. sakaiensis и выключили ее в плазмиду. Плазмиды – это генетические последовательности, которые могут распространяться (создавать свои копии) в клетке независимо от собственной хромосомы клетки. Другими словами, можно внедрить плазмиду в чужеродную клетку, и эта клетка будет выполнять инструкции, заложенные в ДНК плазмиды. Именно так и сделали в этой работе