Обзор: "НАУКА и ОБЩЕСТВО". НАУКА. 4.

События первой половины августа из мира науки для Вас - в коротком обзоре "НАУКА и ОБЩЕСТВО. НАУКА.4."

 

В каталоге «Unknome» содержится почти 2 миллиона белков. Многие из них остаются загадочными

Новая база данных может быть использована для поиска способов лечения заболеваний или открытия лекарств

Когда речь заходит об обширных, малоизученных границах, на ум приходят космос и океаны Земли. Но даже в человеческих телах еще многое предстоит открыть. Познакомьтесь с «Unknome», новой базой данных, которая подчеркивает, как много мы до сих пор не знаем о человеческих генах и белках.

Общедоступная база данных ранжирует группы белков по тому, насколько мало о них известно. Эта информация может помочь ученым идентифицировать белки для будущих исследований, в том числе для лечения заболеваний и создания лекарств, сообщают исследователи 8 августа в PLOS Biology.

Клеточный биолог Шон Манро и его коллеги составили Unknome (из слов unknown и genome) для идентификации малоизученных, но потенциально важных белков и соответствующих им генов, кодирующих белки: ДНК, которая копирует рецептуру белка в РНК (SN: 2/9/22).

Белки обычно группируются в семейства, имеющие общего эволюционного предка. База данных Unknome содержит все семейства белков, в которых по крайней мере один белок закодирован в руководстве по генетике человека, или геноме, или геномах 11 других широко изучаемых организмов. В него включено более 13 000 групп и почти 2 миллиона белков.

https://www.sciencenews.org/article/unknome-catalog-genome-protein-mysterious

НОВЫЙ АЛГОРИТМ ПОМОГ НАЙТИ ТЫСЯЧИ ПОВТОРЯЮЩИХСЯ ЭЛЕМЕНТОВ В ГЕНОМАХ БАКТЕРИЙ 

Ученые из ФИЦ Биотехнологии РАН разработали математический алгоритм, позволяющий с высокой точностью находить повторяющиеся элементы в геномах. Авторы протестировали подход на генетических последовательностях девяти видов бактерий, и у всех из них обнаружили ранее неизвестные повторы. Так, например, оказалось, что почти 50% генома кишечной палочки представлено довольно длинными повторами (размером 400–600 пар нуклеотидов). Эти повторы представляют собой определенный код, который наложен на существующие гены бактерий поверх кодирования аминокислот. Найденные повторы могут помочь находить новые генетические мишени, интересные с точки зрения биотехнологии, например, участки ДНК, воздействие на которые позволит увеличить продуктивность бактериальных штаммов. Результаты исследования опубликованы в International Journal of Molecular Sciences. 

https://scientificrussia.ru/articles/novyj-algoritm-pomog-najti-tysaci-povtorausihsa-elementov-v-genomah-bakterij 

Обнаружен новый маркер для диагностики заболеваний, связанных с демиелинизацией ЦНС

Новым потенциальным маркером демиелинизирующих заболеваний ЦНС оказались антитела IgA к миелиновому олигодендроцитарному гликопротеину (MOG). Международный коллектив ученых обнаружил эти антитела у пациентов, в крови которых не содержалось основных диагностических маркеров (в том числе IgG к MOG), но наблюдались признаки демиелинизации.

Уже известно, что диагноз «рассеянный склероз» может быть поставлен при целом ряде различных демиелинизирующих заболеваний центральной нервной системы, каждое из которых требует индивидуального подхода к лечению. В этом контексте крайне важна дифференциальная диагностика, однако она представляет собой сложную задачу, поскольку некоторые пациенты с такими симптомами серонегативны — в их крови не обнаруживается характерных биомаркеров. Международная группа ученых обнаружила новый потенциальный маркер для диагностики заболеваний, связанных с демиелинизацией центральной нервной системы.

https://jamanetwork.com/journals/jamaneurology/fullarticle/2808235%20

"Шум" генов с низкой экспрессией может быть даже ниже, чем предполагалось

Согласно новому исследованию, опубликованному в журнале Science Advances, экспрессия некоторых генов даже менее "шумная", чем предполагалось ранее. Экспрессия генов зависит от стохастических взаимодействий между ДНК и белками, поскольку частота их взаимодействия зависит от их количества в клетках. Ранее ученые обнаружили, что некоторые гены имеют более высокий уровень шума, чем другие, например гены «домашнего хозяйства», экспрессия которых, как ожидается, будет соответствовать пуассоновскому распределению. Но в новом исследовании исследователи из Технологического института Вирджинии и других мест изучают гены клеточного цикла у делящихся дрожжей Schizosaccharomyces pombe, уровни экспрессии которых упали ниже ожидаемого минимума.

https://www.genomeweb.com/scan/noise-low-expression-genes-may-be-even-lower-thought

Исследование выявило уникальный молекулярный профиль костного мозга черепа человека и мышей

Исследователи из Германии обнаружили, что костный мозг из черепов мышей и человека имеет отличный молекулярный профиль по сравнению с другими костями в организме.
В исследовании, опубликованном в Cell 09 августа 2023, команда, возглавляемая исследователями из Института тканевой инженерии и регенеративной медицины (iTerm) в Центре Гельмгольца в Мюнхене, описала использование транскриптомики, протеомики и различных методов визуализации черепа и других образцов обоих видов.

Их данные показали перекрестное взаимодействие иммунных клеток в человеческом черепе и головном мозге, что позволяет предположить, что череп может отражать патологию головного мозга, такую как воспаление нервной ткани, связанное с расстройствами центральной нервной системы.

"Наше открытие обладает огромным потенциалом, поскольку предполагает, что в ближайшем будущем портативные устройства или даже небольшие датчики, подобные тем, что используются в умных часах, могут быть использованы для ранней диагностики и непрерывного мониторинга заболеваний головного мозга", - сообщил Али Эртурк, директор института.

https://www.genomeweb.com/genetic-research/study-finds-unique-molecular-profile-human-mice-skull-bone-marrow 

Подпишитесь на нашу рассылку

Будьте всегда в курсе всех событий и открытий в мире биологии

Поделиться записью: