Экскурсия в Геномный центр РНИМУ

7 марта состоялась очередная экскурсия АМКСБ. В этот раз у себя в гостях участников принял Геномный центр РНИМУ, находящийся на базе РНИМУ им. Н.И. Пирогова.

Центр специализируется на исследованиях с применением технологий высокопроизводительного секвенирования нуклеиновых кислот (NGS).

Руководитель группы секвенирования геномного центра Дмитрий Коростин провёл участников экскурсии по лаборатории и рассказал, что геномный центр является лабораторией  полного цикла и работа включает в себя все этапы от пробоподготовки образцов до биоинформатической обработки данных и клинической интерпретации. 
«Кроме того, мы разрабатываем собственные IT-решения для оптимизации рабочих процессов, при этом наши задачи отвечают как в научным, так и клинических целям.

Центр максимально автоматизирован, начиная с этапа поступления все образцы вносятся в ЛИС и проходят цепочку роботизированных этапов: выделение, подготовка смеси, обогащение библиотек. В зоне секвенирования находятся два высокопроизводительных секвенатора MGI. В составе центра работает своя команда биоинформатиков.

Основное направление работы центра - это секвенирование экзома человека. В центре разработаны и применяются собственные методики для подготовки образцов и их последующей обработки внутри лаборатории. Наши методы были проверены согласно международным геномным стандартам и опубликованы в авторитетных научных журналах. Кроме того, мы создали собственную лабораторную информационную систему (ЛИС), специально адаптированную для задач NGS. У нас имеются надежные и проверенные решения для обработки, анализа и хранения данных, на которые мы полностью полагаемся». 

Основные виды исследований с которыми работает центр сейчас помимо секвенирования экзома человека, находятся в области носительства наследственных заболеваний, исследования биоптата опухоли, HLA- типирования высокого разрешения. 

«Нам интересно развиваться и пробовать себя в новых областях, я считаю, что для нашего центра нет невыполнимых задач в области секвенирования. Мы всегда рады коллаборациям, это возможность расширить кругозор, обменяться опытом с другими специалистами, и реализовать новые, потенциально успешные проекты».

Подробнее о центре: https://genomecenter.ru/